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BioSolvetIT SeeSAR中文激活版是面向药物研发领域的交互式分子设计可视化平台,适配药物化学家开展分子改造与化合物研发工作。软件覆盖虚拟筛选、片段衍生分子设计整套工作流程,帮助探索结合腔的未占区域并生成新的知识产权。

1、下载BioSolvetIT Seesar资源包,进行解压获得BioSolvetIT Seesar安装包


2、默认进行安装

3、安装完成不要立即运行

4、将patch文件夹中的exe文件复制到BioSolvetIT Seesar目录下进行覆盖

5、之后打开BioSolvetIT Seesar即为注册版本

一、直观的靶标准备与结合口袋检测
软件支持通过拖拽方式导入蛋白质结构,也可直接在线数据库中搜索目标。软件会自动检测配体结合位点,用户也可通过添加单个残基或一键操作精确扩展结合口袋范围,并自定义侧链和探索旋转异构体。
二、灵活的分子编辑与实时反馈
支持在二维和三维视图中即时修改分子结构,所有操作实时生效。完成修改后,分子可直接用于后续的对接、筛选和评估任务。
三、HYDE亲和力评估与ADME属性预测
软件基于HYDE评分方法对配体与靶标的结合亲和力进行可视化评估,同时支持对化合物进行ADME性质计算和相关参数筛选,帮助优化药物的类药性。
四、ReCore骨架替换与灵感激发
在Inspirator模式下,ReCore工具可在预处理索引库中搜索匹配分子区域的替代骨架,支持探索结合腔的未占区域、连接分子片段或替换现有骨架以生成新的化学空间。
五、一键对接与虚拟筛选
支持一键完成化合物对接,可对化合物库进行活性筛选并直观评估对接结果。基于分子相似性进行配体叠合,无需靶标结构即可完成分析。
六、空置结合口袋可视化
软件可通过颜色编码方式清晰显示蛋白质表面未占据的空腔区域,为分子生长和片段连接提供直接的视觉指引。
项目初始化与结构导入:启动软件后新建专属药物设计项目,导入提前准备好的靶点蛋白三维结构和初始配体分子文件,软件会自动完成蛋白结构的预处理,补全缺失的氨基酸侧链、添加氢原子,快速完成项目的初始环境搭建。
结合口袋可视化分析:进入结合腔分析模块,软件自动识别靶点蛋白的潜在结合口袋,通过内置的色彩编码功能渲染出空腔内的各类作用特征,直观标记出疏水热点、氢键供体受体位点,快速定位后续分子修饰的关键区域。
初始分子结合模式评估:导入你手头的先导化合物分子,运行结合亲和力计算,查看软件生成的原子级亲和力贡献可视化结果,定位当前分子中结合作用较弱的局部位点,明确第一轮分子结构优化的具体方向。
分子侧链修饰与延伸:进入配体编辑界面,针对结合空腔内尚未被分子填充的空白区域,直接在可视化界面中为分子添加延伸侧链,软件实时反馈修改后的分子亲和力变化,快速筛选出能充分利用结合空腔的最优侧链基团。
ReCore骨架跃迁操作:切换到Inspirator模式,选中你想要替换的分子核心骨架区域,指定提前构建好的预处理片段索引库,启动ReCore检索,软件会快速返回大量适配该区域的替代片段,自动生成大量全新骨架的衍生分子。
ADME成药性同步优化:在分子设计的全过程中,实时查看界面侧边栏同步更新的ADME属性参数,调整分子结构的同时同步优化溶解度、代谢稳定性等关键成药性指标,避免后续生成的新分子活性达标但成药性不合格。
操作系统:Windows10/1164位;支持Linux系统。
CPU:最低4核处理器;处理大化合物库、片段检索建议8核以上。
内存:最低8GB;处理蛋白?配体体系建议16GB及以上;大批量虚拟筛选建议32GB内存。
硬盘:至少10GB可用存储空间,固态盘可以加速片段索引读取。片段库索引文件会占用较多磁盘空间。
显卡:支持OpenGL独立显卡,显存2GB以上,用于3D分子结构渲染显示。
其他:PDB、SDF等输入文件路径不要包含中文;大的片段库索引会消耗内存资源。
此内容由AI根据文章内容自动生成,并已由人工审核
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